Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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