Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx49Q4FZF3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms