Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms