Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms