Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms