Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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