Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms