Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms