Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms