Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms