Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms