Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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