Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec11Q3SXB8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms