Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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