Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp8Q2V6D6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms