Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttc39dQ0VF76 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttc39dQ0VF76 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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