Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms