Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf541Q0GGX2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms