Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms