Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms