Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms