Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Grin2cQ01098 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms