Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms