Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms