Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms