Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms