Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ctdsp1P58466 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ctdsp1P58466 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ctdsp1P58466 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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