Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CnbpP53996 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms