Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms