Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms