Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms