Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtlP38585 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtlP38585 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TtlP38585 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms