Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms