Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab5cP35278 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab5cP35278 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab5cP35278 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab5cP35278 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab5cP35278 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab5cP35278 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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