Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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