Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxraP28700 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxraP28700 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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