Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms