Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms