Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nfkb1P25799 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms