Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms