Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms