Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VimP20152 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
VimP20152 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VimP20152 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VimP20152 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VimP20152 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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