Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms