Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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