Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-Eb1P04230 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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