Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P04212 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P04212 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms