Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ifnb1P01575 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms