Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BlmO88700 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BlmO88700 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BlmO88700 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BlmO88700 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms