Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarce1O54941 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarce1O54941 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms