Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FxnO35943 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FxnO35943 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FxnO35943 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FxnO35943 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms